Orgeneral Başbuğ, bu meydana gelen olayla ilgili olarak, dün gece bazı televizyon kanallarında yapılan programlarda ve bugün bazı gazetelerde, "gözaltına alma olayıyla 24 Haziran günü Başbakan Recep Tayyip Erdoğan'ın talebi üzerine Genelkurmay Başkanı Orgeneral Yaşar Büyükanıt'ın bilgisi ve izniyle gerçekleştirilen toplantı arasında bir ilişki kurmaya yönelik bazı yorum, ima, değerlendirme ve haberler yapıldığını üzüntüyle gördüğünü" vurguladı. Orgeneral Başbuğ, şöyle konuştu:

"Açık şekilde ifade etmek istiyorum: Yapılan bu yorum, ima ve değerlendirmeler kesinlikle gerçek dışıdır. Söz konusu toplantıda bu konu hiçbir şekilde gündeme gelmemiştir. Zaten gelmesi de mümkün değildir. O zaman bu yapılan yorum, ima ve değerlendirmelere ancak komplo teorisi denilebilir.

Bu komplo teorisini yapanların hepsinin kötü niyetli olduğunu düşünmek istemiyorum. Ancak bu komplo teorilerini üretenlere şu soruyu sormakta yarar var: 'Bu komplo teorileri Türk Silahlı Kuvvetleri'nin birlik ve bütünlüğüne, emir-komutasına zarar vermeye yönelik bazı amaçlara hizmet etmiyor mu? Bu amaca bilerek, bilmeyerek hizmet etmiş olmuyorlar mı?' Bu soruyu sormak bizim hakkımız.

TSK'nın birlik bütünlüğüne gereken hassasiyeti göstermek yalnız personelinin değil, herkesin üstünde durması gereken önemli bir husustur.

Türkiye olarak zor günler yaşıyoruz. Hepimiz sağduyulu, soğukkanlı, daha dikkatli ve sorumlu davranmak mecburiyetindeyiz ve zorundayız."

Orgeneral İlker Başbuğ, bu konuda medyaya da büyük bir görev ve sorumluluk düştüğüne de dikkati çekti. 
 
Genelkurmay'dan açıklama

Genelkurmay Başkanlığı, Ergenekon Operasyonu kapsamında dün gerçekleştirilen aramaların, 5271 sayılı Ceza Muhakemesi Kanunu'nun, "Askeri mahallerde yapılacak aramanın, Cumhuriyet savcısının istem ve katılımıyla askeri makamlar tarafından yerine getirilir" hükmüne istinaden yapıldığını bildirdi. Genelkurmay Başkanlığı internet sitesinde, Ergenekon operasyonuna ilişkin bir açıklama yaptı.

Açıklamada şunlar kaydedildi: "Bir süredir yürütülmekte olan bir soruşturma kapsamında, 01 Temmuz 2008 günü, içlerinde üst rütbeli emekli askerlerin de bulunduğu bazı şahıslar adli makamlarca gözaltına alınmış ve bu şahıslara ait ev ve işyerlerinde aramalar yapılmıştır.
 
İcra edilen arama ve gözaltı uygulamalarının bir kısmı, askeri mahallerde bulunan lojman ve sosyal tesislerde vuku bulmuştur.
 
Uygulamalardan sonra bazı basın ve yayın organlarındaki haberlerde, "Bu uygulamaların Genelkurmay Başkanlığı'nın bilgi ve izniyle yapıldığı" şeklinde yorumlara yer verilmiştir.
Aramalar, 5271 sayılı Ceza Muhakemesi Kanunu'nun 119'uncu maddesi 5'inci fıkrasındaki "Askeri mahallerde yapılacak arama, Cumhuriyet savcısının istem ve katılımıyla askeri makamlar tarafından yerine getirilir" hükmüne istinaden yapılmıştır." 
  
Kaynak:Ajanslar/Türkiye